Depois dos ipês, é chegada a hora da comunidade acadêmica se encantar com o florescimento do pau-brasil na Cidade Universitária. A espécie é considerada em perigo de extinção em razão da intensa exploração econômica iniciada no século XVI pela Coroa Portuguesa por conta das propriedades tintoriais de sua madeira, vastamente utilizada para tingir tecidos na época.
Considerada a Árvore Nacional, por força da Lei Federal n. 6.607, de 7 de dezembro de 1978, em reconhecimento ao seu valor histórico e cultural, o pau-brasil (Paubrasilia echinata) exala beleza e perfume no campus, colorindo o cenário de quem circula pela Ilha do Fundão.
Espécie nativa da Mata Atlântica, que floresce na primavera, possui entre 10 e 20 metros de altura, de madeira dura e resistente. O caule lenhoso possui em seu interior cor vermelha, apresenta flores aromáticas com quatro pétalas amarelas e uma central menor e modificada de cor vermelha, além de frutos em forma de vagens, protegidos por espinhos.
Visando promover a conservação da espécie e a qualidade ambiental na Cidade Universitária, a Prefeitura Universitária, através da COUA, tem promovido o plantio e, ocasionalmente, a distribuição na UFRJ de exemplares de pau-brasil cultivados no Horto Universitário. Estas atividades buscam conscientizar a população sobre a importância da preservação da flora brasileira e da conservação dos recursos naturais.
Além de exemplares de pau-brasil avistados na Praça Jorge Machado Moreira, próximos à Prefeitura Universitária, outros podem ser observados na Faculdade de Letras, no Centro de Tecnologia, na lateral da Faculdade de Farmácia, dentre outras unidades na Cidade Universitária.
